Nieuwe methode haalt meer gezondheidsdata uit rioolwater

In dit artikel:

Een nieuwe methode van de Technische Universiteit Delft maakt het mogelijk om naast DNA, RNA en geneesmiddelen ook grote aantallen eiwitten in rioolwater te identificeren. Daarmee kan afvalwater meer informatie geven over de gezondheid van een bevolking, bijvoorbeeld over infecties en ziekten.

In een proof-of-conceptstudie onderzocht het team van biochemisch onderzoeker dr. Martin Pabst en promovenda Claudia Tugui drie maanden lang monsters uit de rioolwaterzuiveringsinstallaties van Delft en Utrecht. De onderzoekers vonden ongeveer 200 menselijke eiwitten, waaronder eiwitten die in verband worden gebracht met kanker, virale ontstekingen en functionerende antilichamen.

De methode, de novo-metaproteomica, analyseert eiwitten uit een zeer complexe mix van menselijke, bacteriële en plantaardige resten. Met behulp van massaspectrometrie worden eiwitten eerst in kleine fragmenten geknipt. Die peptiden worden gescheiden, geïoniseerd en op basis van hun massa en aminozuursequentie geïdentificeerd. Moderne massaspectrometers zijn pas de afgelopen twintig jaar nauwkeurig genoeg geworden om zulke mengsels betrouwbaar te onderzoeken. Volgens Pabst kan de techniek niet alleen ziekte-indicatoren zichtbaar maken, maar ook inzicht geven in micro-organismen en hun functies in afvalwater.